%0 Journal Article %T 同源四倍体与二倍体水稻基因组及甲基化差异分析 %A 杨琼 %A 李辉 %A 左钦月 %A 邱琳 %A 陈丽 %A 罗科 %A 涂升斌 %J 应用与环境生物学报 %P 630-636 %D 2013 %R 10.3724/SP.J.1145.2013.00630 %X dna甲基化在真核生物的生长发育过程中起着重要的调控作用.为了解水稻同源四倍体与二倍体之间的基因组及甲基化修饰差异,探究二倍体与同源四倍体的遗传差异和基因组dna甲基化水平及模式变化,以冈46b、明恢63、绵恢725、成恢149、海天、什香6个二倍体水稻及相应的6个同源四倍体水稻为材料,采用微卫星分子标记技术(ssr)及甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitiveamplificationpolymorphism,msap)分析等方法进行研究.ssr结果显示,所试同源四倍体水稻的基因组与二倍体水稻基因组大部分相同,采用的引物中有3对引物多态性较好,在不同倍性水稻间扩增出特异性条带.经不同倍性甲基化水平分析,同源四倍体材料的平均总甲基化率(24.0%)明显低于二倍体材料的平均总甲基化率(28.15%).两个倍性材料间的全甲基化与半甲基化差异也较大:二倍体材料的全甲基化率平均为6.24%,半甲基化率平均为22.03%;同源四倍体水稻材料全甲基化率平均为7.44%,半甲基化率平均为16.61%.甲基化程度并未因多倍化而增加,这说明同一品种水稻的二倍体与同源四倍体间的dna发生了甲基化修饰变化.进一步对不同倍性水稻dna甲基化模式的变化特征进行分析,结果显示同源四倍体水稻中平均约有11.6%发生了去甲基化,平均约有24.11%位点发生了过甲基化,过甲基化基因的比例显著高于去甲基化的比例.研究表明同源四倍体水稻可能通过对一些功能基因的甲基化不表达,以缓和基因组加倍剂量效应造成的影响.图4表5参29 %K 同源四倍体 %K 二倍体水稻 %K 甲基化 %K 甲基敏感扩增多态性(msap) %U http://www.cibj.com/oa/DArticle.aspx?type=view&id=201208008