%0 Journal Article
%T 甘蔗scot-pcr反应体系优化与多态性引物筛选及应用
%A 苏亚春
%A 凌辉
%A 王恒波
%A 阙友雄
%A 吴期滨
%A 陈珊珊
%A 许莉萍
%J 应用与环境生物学报
%P 810-818
%D 2012
%R 10.3724/SP.J.1145.2012.00810
%X 目标起始密码子多态性（startcondontargetedpolymorphism，scot）分子标记是一种新型的标记，结合了issr标记和rapd标记的优点.本研究针对scot-pcr反应体系的影响因素，以甘蔗叶片dna为材料，在单因子实验的基础上，采用l16(45)正交实验设计，进一步探讨了模板dna、mg2+、dntps、引物及taq酶等5个因素对甘蔗scot-pcr扩增效果的影响，建立了甘蔗scot-pcr的优化反应体系.25μlpcr反应混合液中，含50ngdna模板、2.0μl10×extaqbuffer（mg2+plus）、0.625uextaq酶，dntp和引物的终浓度分别为0.22mmol/l和0.9μmol/l.以我国种植面积最大的栽培品种新台糖22号为模板，应用优化体系，对40条scot标记引物进行测试，筛选出16条有效扩增的引物，且均为多态性引物，其gc含量在50%~67%之间.该体系的稳定性和scot标记引物的扩增能力，通过基于随机选择的4条引物对9份具有地理来源和遗传背景不同的甘蔗种质进行标记分析来验证，结果共扩增出84条带，其中多态性条带占82.14%，平均单条引物可扩增出21条.研究结果为在甘蔗上进一步开发和应用功能性scot标记奠定了基础.图9表5参23
%K 甘蔗
%K scot标记
%K 体系优化
%K 引物筛选
%K 多态性能力
%U http://www.cibj.com/oa/DArticle.aspx?type=view&id=201109005