%0 Journal Article
%T 油茶基因组微卫星特征分析
%A 史洁
%A 尹佟明
%A 管宏伟
%A 戴晓港
%A 陈金慧
%A 施季森*
%J 南京林业大学学报(自然科学版)
%P 47-51
%D 2012
%R 10.3969/j.jssn.1000-2006.2012.02.010
%X 对油茶基因组约10%覆盖度的dna序列进行微卫星查找,共获得11344个重复单元长度为1～6碱基的微卫星。在此基础上,通过对这些微卫星序列分析发现:在油茶基因组中长度为二核苷酸的微卫星重复单元最为丰富,占27.1%;在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中,最主要的优势重复单元分别是a/t以及at/ta、ag/tc。三碱基、四碱基、五碱基重复类型中,(aan)n、(aaan)n和(aaaan)n为对应的优势重复单元,这些优势重复单元中富含碱基a和t。油茶基因组中变异程度高的微卫星(长度≥20bp)约占11.7%。分析还发现,除单核苷酸重复微卫星外,油茶基因组微卫星长度的变异速率与重复单元长度呈负相关,即油茶基因组中长度较短的微卫星变异速率较快,而较长的重复单元变异速度较慢,相对较为稳定。
%K 油茶
%K 微卫星
%K 重复单元
%K 长度变异
%U http://nldxb.njfu.edu.cn/oa/darticle.aspx?type=view&id=201202010