%0 Journal Article
%T 碧桃花瓣转录组微卫星特征分析
%A 马秋月
%A 廖卓毅
%A 张得芳
%A 戴晓港
%A 陈赢男
%A 李淑娴*
%J 南京林业大学学报(自然科学版)
%P 34-38
%D 2015
%R 10.3969/j.issn.1000-2006.2015.03.007
%X 为开发碧桃转录组微卫星信息,利用454高通量测序技术,对其花瓣转录组序列进行ssr位点发掘,结果发现含ssr的序列4705条,共得到5668个ssr,平均每3.49kb出现1个ssr。微卫星序列主要以三碱基重复为主,约占总数的42.66%。笔者共发现516种碱基重复基元,所占比例最高的为(ag/ct)n(18.34%),其次是(aag/ctt)n(12.42%)。微卫星多为重复长度小于20bp的短序列,长度大于20bp的微卫星仅占总数的12.13%。研究还发现碧桃花瓣微卫星的频率和长度呈显著负相关(p<0.05),相关系数为-0.246。
%K 碧桃
%K 微卫星
%K ssr
%K 转录组
%K 高通量测序
%U http://nldxb.njfu.edu.cn/oa/darticle.aspx?type=view&id=201503007