%0 Journal Article
%T csfv陕西分离株sxcdk全基因的克隆与分析
%A 李玲伟？
%A 张 志？
%A 吴发兴？
%J 西北农林科技大学学报(自然科学版)
%P 1-7
%D 2011
%X 【目的】分离猪瘟病毒（csfv）sxcdk株，测定其全基因组序列，研究其分子特性及与其他毒株的亲缘关系，为猪瘟病毒分子流行病学研究积累材料。【方法】从陕西省西安市采集疑似猪瘟病料进行病毒分离，获得猪瘟病毒sxcdk株。根据genbank上发表的猪瘟病毒全基因序列及相关参考文献，合成11对引物，应用rt-pcr技术分11段扩增csfv分离株sxcdk基因，拼接后获得其全基因组(genbank登录号:gq923951)。利用dnastar、clustalx1.83和mega-4.1等软件，对分离株sxcdk与其他猪瘟病毒毒株的核苷酸和氨基酸序列进行比较分析。【结果】csfv陕西分离株sxcdk基因组全长12296nt，由373nt的5′非翻译区、编码3899个氨基酸的11697nt开放阅读框和226nt的3′非翻译区组成。分离株sxcdk和其他毒株的核苷酸序列同源性为83.6%～96.2%，氨基酸序列的同源性为91.3%～97.8%。从进化的角度来看，分离株sxcdk与台湾分离株96td的亲缘关系最近，两者之间的进化距离为0.038，分离株sxcdk与2006年陕西省分离株sxyl2006进化距离较远，两者之间的进化距离为0.065。csfvsxcdk株属于2.1a亚群毒株。【结论】分离株sxcdk是我国内地首株已确定全基因序列的猪瘟病毒2.1a亚群毒株，与同亚群的96td亲缘关系最近。
%K 猪瘟病毒
%K 全基因
%K 分离株sxcdk
%K 序列分析
%K 2.1a亚群
%U http://www.xnxbz.net/xbnlkjdxzr/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20110101&flag=1