%0 Journal Article %T 转录本组装与质量评价 %A 邓飞龙? %A 贾先波? %A 赖松家? %A 刘益平? %A 陈仕毅? %J 生物工程学报 %P 1271-1278 %D 2015 %R 10.13345/j.cjb.140508 %X 转录本组装是基于第二代测序技术研究转录组的关键环节,其质量好坏直接影响到下游结果的可靠性,也是目前的研究热点与难点。转录本组装方法可以分为genome-guided和denovo两类,它们在理论基础与算法实现方面各有优劣。转录本组装质量的高低依赖于pcr扩增错误率、第二代测序技术准确率、组装算法和参考基因组完整性等方面,而现有的算法还无法完全处理由这些因素带来的影响。本文从转录本组装方法与软件、影响组装质量的因素和对组装质量的评价指标等方面进行讨论,以期能指导纯生物学家对分析软件的选择。 %K 转录组 %K 第二代测序 %K 组装软件 %K 转录组测序 %U http://journals.im.ac.cn/cjbcn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=gc15091271&flag=1