%0 Journal Article %T 马铃薯腐烂茎线虫l型半胱氨酸蛋白酶新基因(dd-cpl-1)的克隆与序列分析 %A 王高峰? %A 彭德良? %A 孙建华? %A 黄文坤? %A 彭焕? %A 龙海波? %J 生物工程学报 %P 60-68 %D 2011 %X l型半胱氨酸蛋白酶基因(cathepsinl-likecysteineproteinasegene)为与植物寄生线虫寄生能力相关的多功能基因。运用rt-pcr和race的方法从马铃薯腐烂茎线虫ditylenchusdestructor中克隆出1个l型半胱氨酸蛋白酶新基因dd-cpl-1(genbank登录号为gq180107)。该基因dd-cpl-1cdna全长序列含有1个1131bp的开放性阅读框(orf),编码376个氨基酸残基,其5′末端及3′末端分别含有29bp和159bp的非编码区(utr)。dd-cpl-1内含子外显子结构分析结果表明,其基因组序列包含7个内含子,且各内含子两端剪接位点序列遵守gt/ag规则。dd-cpl-1基因推定的蛋白dd-cpl-1与松材线虫l型半胱氨酸蛋白酶高度同源,一致性达到77%。以不同物种中l型半胱氨酸蛋白酶氨基酸序列进行比对分析,推测推定的蛋白dd-cpl-1含有l型半胱氨酸蛋白酶基因家族高度保守的催化三联体(cys183,his322和asn343)以及erfnin基系和gnfd基系。半胱氨酸蛋白酶系统发育分析表明,dd-cpl-1属于由l型半胱氨酸蛋白酶组成的进化分支。dd-cpl-1的这些序列特征进一步表明其为l型半胱氨酸蛋白酶基因。这是首次在马铃薯腐烂茎线虫中克隆到的l型半胱氨酸蛋白酶,为今后在蛋白水平对其进行进一步的功能分析提供基础。 %K 马铃薯腐烂茎线虫 %K l %K 型半胱氨酸蛋白酶 %K dd-cpl-1 %U http://journals.im.ac.cn/cjbcn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=gc11000060&flag=1