%0 Journal Article %T 基于hnp三态模型及相对熵方法的蛋白质折叠研究 %A 苏计国? %A 王宝翰? %A 焦 雄? %A 陈慰祖? %A 王存新? %J 生物化学与生物物理进展 %D 2006 %X 把20种氨基酸简化为3类:疏水氨基酸(hydrophobic,h)、亲水氨基酸(hydrophilic,p)及中性氨基酸(neutral,n),每个氨基酸简化为一个点,用其cα原子来代替.采用非格点模型,以相对熵作为优化函数,进行蛋白质三维结构预测.为了与基于相对熵方法的蛋白质设计工作进行统一,采用了新的接触强度函数.选用蛋白质数据库中的天然蛋白质作为测试靶蛋白,结果表明,采用该模型和方法取得了较好的结果,预测结构相对于天然结构的均方根偏差在0.30~0.70nm之间.该工作为基于相对熵及hnp模型的蛋白质设计研究打下了基础. %K 氨基酸简化模型 %K 相对熵 %K 蛋白质折叠 %U http://www.pibb.ac.cn/pibbcn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=2005-0960&flag=1