%0 Journal Article %T 一种基于mesh主题词的临床?鄄组学关系挖掘方法 %A 冯亚宁? %A 焦梦映? %A 段会龙? %A 邓宁? %J 生物化学与生物物理进展 %D 2015 %X 癌症的发生发展与机体内基因的改变有密切联系,在临床上表现为症状或检测指标的异常.通过挖掘分析临床表现与基因改变之间的关系,可为癌症早期诊断和精准治疗提供临床决策支持.从文献数据出发,利用结论性数据挖掘基因与临床表现的关系具有重要意义.本文提出一种基于医学主题词(medicalsubjectheadings,mesh)的生物医学实体关系挖掘方法.该方法利用pubmed中提供的文献信息,借用向量空间模型思想,使用mesh主题词矢量表达待研究实体,引入文献相互引用因素对结果进行修正,将关系挖掘转化为矢量间的数学运算,实现定量分析.本文将该方法应用于结直肠癌临床表现和基因关系的研究中,得到与结直肠癌相关的203个基因和对应的临床-基因462个关系.通过结合使用基因功能和通路分析工具g:profiler和kegg等,对结果进行分析验证.结果表明,基于mesh主题词的文献挖掘方法,避免传统“共现”方法对发现潜在关系的限制和复杂语义分析带来的大量计算,为生物实体之间潜在关系的挖掘提供一种新的思路和方法. %K 文献挖掘 %K 定量分析 %K 关系挖掘 %K 结直肠癌 %K pubmed %K mesh %U http://www.pibb.ac.cn/pibbcn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20150129&flag=1