%0 Journal Article
%T 蛋白质与极性配体复合物的绝对结合自由能计算
%A 王存新？
%A 宋伟？
%A 陈慰祖？
%J 生物化学与生物物理进展
%D 2003
%X 介绍了用分子动力学模拟与热力学积分法相结合，模拟蛋白质与配体的绝对结合自由能的方法.通过分子转换法，使蛋白质分子（包括水分子）与配体小分子之间的相互作用逐渐减弱（或增强）至完全消失（或完全出现）.运用体约束方法，计算了配体与受体结合后平动、转动自由度的丧失即熵效应所引起的自由能变化.以胰蛋白酶双突变体（d189g/g226d）与极性配体苯甲脒为例，研究了蛋白质活性部位与极性配体的相互作用对结合自由能的影响，该复合物绝对结合自由能的模拟结果(－15.5kj/mol)与实验值(－10.5kj/mol)相近.
%K 分子转换法
%K 热力学积分法
%K 蛋白质-配体复合物
%K 结合自由能
%U http://www.pibb.ac.cn/pibbcn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20030127&flag=1