%0 Journal Article
%T 泥蚶34个est-ssr标记的开发及在格粗饰蚶中的通用性检测
%A 董迎辉？
%A 吴国星？
%A 姚韩韩？
%A 边平江？
%A 赵德旻？
%A 林志华？
%J 水产学报
%P 70-77
%D 2013
%R DOI:10.3724/SP.J.1231.2013.38307
%X 利用泥蚶转录组高通量测序、拼接获得的大量est序列开发ssr标记,在1123条est序列里筛查到73条含有ssr位点的est序列,其中54个位点适合设计引物,在位点两侧设计引物并进行pcr扩增。结果显示,46对引物获得稳定扩增的位点,引物在泥蚶奉化群体的多态性检测中发现,有34对引物表现出多态性,共扩增出122个等位基因,各位点的等位基因数na为2～7个,平均每个位点产生3.59个等位基因,观测杂合度ho、期望杂合度he、多态信息含量pic范围分别为0.000～0.600、0.078～0.771、0.106～0.718;hardy-weinberg平衡检测显示,13个位点偏离了平衡状态;用nr和swiss-prot蛋白质数据库对含有多态性ssr的est进行了基因注释,25个ssr位点来自注释基因序列。将34对泥蚶多态性ssr引物在格粗饰蚶中进行了通用性检测,结果有11对成功扩增,8对表现为多态,通用率为23.53%,这些通用引物可用于两种蚶的遗传多样性评价、系统进化分析、比较作图和基因发掘等研究。
%K 泥蚶
%K est-ssr
%K 多态性
%K 通用性
%K 格粗饰蚶
%U http://www.scxuebao.cn/scxuebao/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20120808307&flag=1