%0 Journal Article
%T 芬太尼类化合物与阿片μ受体相互作用的分子对接与分子动力学模拟
%A 李博
%A 刘明
%A 胡文祥
%J 物理化学学报
%D 2010
%X 采用分子对接和分子动力学(md)模拟方法研究了芬太尼类化合物与阿片μ受体的相互作用机制.先用autodock4.0程序将芬太尼类化合物对接到同源模建的阿片μ受体结构中,再用gromacs程序包在水溶液体系中分别对12个芬太尼激动剂和阿片μ受体蛋白复合物进行了md模拟研究,优化对接复合物的结构,最后利用mm-pbsa方法,在apbs程序中计算芬太尼类衍生物与阿片μ受体的结合自由能,计算出的受体配合物结合常数(ki)与其实验值吻合较好,并预测了化合物的活性排序.结果表明,复合物蛋白结构与空载受体蛋白结构有较大差异,特别是胞内区il2、il3和跨膜区段tm4骨架构象变化较大,不同的化合物对受体结构影响也有差异,活性较好的化合物会增加蛋白特定区域结构的柔性.芬太尼类化合物可能是通过和受体结合后诱导阿片μ受体构象转变为活性构象,引起一系列的信号传导激活g蛋白,从而引发生理效应.
%K 分子动力学
%K 芬太尼
%K 阿片μ受体
%K 分子对接
%U http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract26841.shtml