%0 Journal Article %T 口蹄疫病毒ot株的全基因组序列测定及比较分析 %A 吕占禄 %A 王光祥 %A 尚佑军 %A 刘湘涛 %J 牲畜兽医学报 %P 90-97 %D 2012 %X ?参考genbank上已发表的口蹄疫病毒(fmdv)全长基因组序列,设计了覆盖基因组全长的数对引物,通过rtpcr方法对口蹄疫病毒ot株进行分段克隆及序列测定。结果表明不含poly(c)序列的ot株基因组全序列长8142nt,开放读码框(orf)长6969nt、编码2322aa,5′utr长1004nt,3′utr长93nt,3′utr之后为23nt的poly(a)尾巴。应用分子生物学软件将ot株与fmdv其它参考毒株进行序列比对,并对其基因特征进行分析。结果显示,ot株的假结节(pseudoknots)从第415—499位连续缺失85nt,但是其3a基因却未发生碱基的缺失。其vp1基因的核苷酸同源性与o/akesu58、omⅲ两株最高,但ot株在进化时间上要比o/akesu58、omiii早很多,其毒株起源和遗传衍化关系还需要进一步的关注。 %K 口蹄疫病毒 %K 全基因组 %K 编码区 %K 分子生物学特性 %K 序列比对 %U http://118.145.16.233/Jweb_xmsy/CN/abstract/abstract12552.shtml