%0 Journal Article
%T 应用深度测序技术鉴定平菇球形病毒
%A 王少杰
%A 王廿
%A 师迎春
%A 胡晓艳
%A 周涛
%J 生物技术通报
%P 86-91
%D 2014
%R 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2014.12.014
%X 旨在鉴定采集于北京顺义的畸形平菇样品中的病毒，提取总RNA，构建小RNA库，对小RNA库进行深度测序。测序结果表明，与平菇球形病毒(Oystermushroomisometricvirus，OMSV)基因组序列(NC_004560.1)匹配的小RNA共有3075条，分布在OMSV基因组的不同位置，形成一些热点区域。经拼接，获得了3条长度大于500个核苷酸的序列。根据其中覆盖OMSV外壳蛋白(Coatprotein，CP)基因的序列(seq22)中相对保守区域，设计引物，利用RT-PCR扩增获得cp基因部分序列。序列比对表明，其与OMSV相应区域序列相似度为91%，证实了OMSV在畸形平菇样品中的侵染。同时，将深度测序结果与现有4种siRNA预测软件的预测结果进行比较，发现测序结果与软件预测结果之间存在差异，讨论了这一差异出现的原因。
%K 平菇
%K 深度测序
%K 平菇球形病毒
%K 小干扰RNA
%K 重叠群
%U http://biotech.caas.cn/CN/abstract/abstract10482.shtml