%0 Journal Article
%T 诸氏鲻虾虎鱼转录组序列中微卫星标记的初步筛选及特征分析
%A 蔡磊
%A 余露军
%A 陈小曲
%A 叶惠欣
%A 陈琳
%A 李建军
%J 生物技术通报
%P 146-151
%D 2015
%R 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.09.020
%X 旨在为大规模开发诸氏鲻虾虎鱼微卫星标记，采用高通量测序技术，对诸氏鲻虾虎鱼肝脏转录组进行了测序。结果共获得47979条Unigenes，利用微卫星查找程序在47979条Unigenes中共获得6225个微卫星位点(12.97%)，平均每7.02kb就出现1个微卫星位点。6225个微卫星位点由226种重复基序组成，主要分布在三、四和五碱基重复类型中。在数量上，单碱基重复类型微卫星位点最多，占42.49%，二碱基和三碱基重复类型所占比例相似，分别为25.22%和26.27%，四、五、六重复类型较少，合计占6.03%。单碱基重复序列中最多的类型为A/T，二碱基重复序列中以AG/CT重复单元为主，三碱基重复序列中以AGC/TCG为优势类型。挑选部分二、三和四单元重复类型微卫星序列，共设计76对引物，可稳定扩增出目的条带的有55对，其中32对具有多态性。结果表明，利用诸氏鲻虾虎鱼转录组数据可快速大量开发微卫星标记。
%K 诸氏鲻虾虎鱼
%K 转录组序列
%K 微卫星
%K 筛选
%K 分布特征
%U http://biotech.caas.cn/CN/abstract/abstract10810.shtml