%0 Journal Article
%T 溶藻弧菌HY9901外膜蛋白OmpH的基因克隆及其生物信息学分析
%A 周泽军
%A 庞欢瑛
%A 丁燏
%A 简纪常
%A 吴灶和
%J 生物技术通报
%P 116-122
%D 2013
%X 根据已发表的溶藻弧菌（Vibrioalginolyticus）全基因组序列设计1对特异性引物，PCR扩增溶藻弧菌HY9901株外膜蛋白OmpH的全长基因。结果显示，该基因（GenBank登录号：JX855924）全长573bp，共编码190个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子量约为21.1kD，等电点为9.02。SignalP4.0、TMHMMServer2.0和SoftBerry-Psite预测结果显示，OmpH不存在信号肽与跨膜区，含有1个N-糖基化位点，6个磷酸化位点，1个内质网靶信号位点以及3个微体C末端靶信号位点。利用MAGE5.0软件，以邻位相连法构建OmpH系统进化树，结果显示，溶藻弧菌OmpH与副溶血弧菌（Vibrioparahaemolyticus）、哈氏弧菌（Vibrioharveyi）等有较近亲缘关系。采用多种参数成功预测了OmpH可能的B细胞抗原优势表位，分别是第5-10、106-110、120-125、158-163和175-180区段。利用SWISS-MODEL软件，模拟了OmpH亚基三维结构模型，且与其同源蛋白大肠杆菌（Escherichiacoli）Skp蛋白有相似构型。
%K 溶藻弧菌
%K 基因克隆
%K OmpH
%K 基因
%K 外膜蛋白
%K 生物信息学分析
%U http://biotech.caas.cn/CN/abstract/abstract9793.shtml