%0 Journal Article
%T 我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析
%J 华南农业大学学报
%D 2009
%R 10.7671/j.issn.1001-411X.2009.01.020
%X 对我国鸭病毒性肝炎病毒(Duckhepatitisvirus,DHV)分离株YZ和CL的全基因组进行了序列测定分析.结果表明,2分离株的基因组全长分别为7713nt和7709nt,包括626nt的5′UTR、6747nt的ORF、314nt的3′UTR以及23nt和19nt的poly(A)尾.结构蛋白VP0含有保守的四肽CPRP,VP3的N端存在一段约20个氨基酸的碱性氨基酸富集区域;VP1缺少RGD(Arg-Gly-Asp)基序.DHV2分离株存在3个不相关的2A蛋白基序,其中2A1蛋白类似口蹄疫病毒属的2A蛋白,2A2蛋白与AIG1蛋白(拟南芥)和GTPase更为相似,2A3蛋白则与副肠孤病毒属的2A2蛋白类型相似;2C蛋白含有保守基序EPxxxxxxGxxGxGK(S/T)、QxxxxxDDxxQ和KGxxxxSxxxxxS/T.3C蛋白含有催化三联体H38-D69-C144;3D蛋白包含KDELR、DxxxxD、GxxSGxxxTxxxNx、YGDD和FLKR等RNA聚合酶的特征基序.基于多聚蛋白、VP1、2C和3C蛋白的进化关系分析结果均表明,DHV分离株与副肠孤病毒属的遗传关系最近,但占据一个清晰的独立遗传谱系,应将DHV单独划属.
%K 鸭病毒性肝炎病毒(DHV)
%K 分离株
%K 基因组测序
%K 基因组分析
%U http://xuebao.scau.edu.cn/zr/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20090120&flag=1