%0 Journal Article
%T 基于NBS-LRR类R基因保守结构域克隆瓠瓜抗病基因同源序列
%A 赵芹
%A 谢大森
%A 何晓明
%A 罗少波
%A 彭庆务
%J 华南农业大学学报
%P 92-98
%D 2015
%R 10.7671/j.issn.1001-411X.2015.05.016
%X 【目的】分离鉴定瓠瓜Lagenariasiceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistancegeneanalogs,RGAs)，为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.【方法】根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotidebindingsiteandleucinerichrepeat,NBS-LRR)类抗病基因保守区设计简并引物，从“大籽瓠”抗性材料基因组DNA中分离抗病基因同源序列，并利用生物信息学软件进行长度变异、保守结构域、同源比对与系统进化分析.【结果和结论】基于同源克隆策略，获得23条瓠瓜NBS抗病同源序列，命名为HNB1~HNB23，GenBank登录号为KJ908192~KJ908214.序列分析及同源比对结果表明，这些RGAs长度变异在242~261nt之间，18条序列具有连续开放阅读框(Openreadingframe,ORF)，推导氨基酸序列具有P-loop、Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域；核苷酸序列相似性为41.5%~98.8%，氨基酸序列相似性为21.5%~100.0%；利用NCBIBlast同源搜索发现，与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40%~100%相似性；氨基酸序列聚类分析将其分为5个组；同源进化分析表明，23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因，与推导氨基酸序列多重比较结果一致.
%K 瓠瓜
%K NBS-LRR类
%K 抗病基因同源序列
%K 简并引物
%K 序列分析
%U http://xuebao.scau.edu.cn/zr/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=201505018&flag=1