%0 Journal Article
%T 大豆吡哆醇生物合成蛋白基因(PDX)的电子克隆和进化分析
%A 李蕊
%A 孟宪萍
%A 胡英考
%A 蔡民华
%A 李雅轩
%J 华北农学报
%P 64-68
%D 2007
%R 10.3321/j.issn:1000-7091.2007.01.015
%X 电子克隆(Insilicocloning)是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法。根据物种间同源基因相对保守的特点，以拟南芥(Arabidopsisthaliana)吡哆醇生物合成蛋白cDNA序列为信息探针，对大豆(Glycinemax)EST数据库进行同源搜索和序列拼接，获得了1280bp长的大豆吡哆醇生物合成蛋白的基因序列(GenBank登陆号为DQ139265)。经过RT-PCR扩增、基因组PCR扩增、分子克隆和序列分析验证，结果表明与电子克隆序列完全一致。该基因具有完整的开放阅读框架(ORF，20～955bp)，编码311个氨基酸。通过与水稻、日本百脉根、烟草、截形苜蓿等物种的吡哆醇生物合成蛋白序列比对，发现该基因具有高度的保守性。表明根据物种间同源基因序列，对跨物种间EST数据库进行同源检索、筛选、拼接，是克隆基因的有效途径。
%K 电子克隆
%K EST数据库
%K RT-PCR
%K 基因组PCR
%K 大豆
%K 吡哆醇生物合成蛋白
%U http://www.hbnxb.net/CN/abstract/abstract3201.shtml