%0 Journal Article
%T 甘蓝型油菜LPAT4基因克隆及其生物信息学分析
%A 肖旦望
%A 刘聪
%A 胡学芳
%A 邬克彬
%A 官春云
%A 熊兴华
%J 华北农学报
%P 52-58
%D 2014
%R 10.7668/hbnxb.2014.03.011
%X 为进一步研究油菜LPAT4基因，通过检索与拟南芥LPAT4序列相似度较高的油菜EST序列，拼接后与白菜和甘蓝的LPAT4序列进行同源比对，设计一对引物，从甘蓝型油菜湘油15中扩增全长LPAT4CDs序列。共获得2条CDs序列，它们的长度分别为1143，1140bp，分别命名为BnLPAT4-1和BnLPAT4-2。BnLPAT4-1编码380个氨基酸，所得蛋白质的相对分子质量和等电点分别为43.29kDa和8.74；BnLPAT4-2编码379个氨基酸，所得蛋白质的相对分子质量和等电点分别为43.16kDa和8.93。他们均具有LPLAT_LCLAT1样结构域，同属于LPLAT超基因家族。比较所用油菜序列SNP分析显示，LPAT4共存在41个多态性位点，其中单变异位点7个，简约信息位点34个。这41个多态性位点中，引起同义变异的位点为23个，引起取代变异的位点18个，共导致16个氨基酸发生改变。分析表明，BnLPAT4-1和BnLPAT4-2为甘蓝型油菜湘油15号LPAT4基因的2个拷贝，从序列组成、理化性质、保守结构域以及同源建模4个方面来看，它们均具备LPLAT超基因家族的特征，为该基因家族的2个成员。
%K LPAT4
%K 甘蓝型油菜
%K 同源建模分析
%K 保守结构域
%K SNP
%U http://www.hbnxb.net/CN/abstract/abstract12.shtml