%0 Journal Article
%T 基于局部结构交互的RNA假结预测
%A 刘元宁
%A 艾露露
%A 段云娜
%A 李誌
%A 田明尧
%A 张浩
%J 吉林大学学报(工学版)
%P 613-618
%D 2015
%X 基于RNA局部结构间的交互作用，提出一种含假结的RNA二级结构预测新方法LIFold。对给定的RNA序列，首先通过能量计算得到不含假结的能量最优结构，然后应用局部结构交互配对生成假结茎区，在已得到的最优结构基础上构建含假结的能量计算模型，最后通过优化算法得到含假结的RNA二级结构。应用该方法基于HotKnots测试数据的敏感性和阳性预测值(PPV)分别达到84%和80%，基于PseudoBase数据库测试数据的敏感性和阳性预测值分别达到78%和73%，与HotKnots、ILM、PknotsRG、IPknot及FlexStem等知名软件相比较，准确率均有所提高。
%K 计算机应用
%K RNA二级结构
%K 假结
%K 最小自由能
%K 交互配对
%U http://xuebao.jlu.edu.cn/gxb/CN/Y2015/V45/I2/613