%0 Journal Article
%T 基于牡丹EST信息的滇牡丹SSR标记开发
%A 张艳丽
%A 王雁
%A 李正红
%A 马宏
%J 林业科学研究
%P 171-175
%D 2011
%X 对NCBI(美国国立生物技术信息中心)中牡丹的ESTs(expressed sequence tags)的序列进行分析,结果表明:在所分析的2 204条序列中,仅324条分布有SSRs(simple sequence repeats),占全部ESTs序列的14.70%;SSR的出现频率为15.20%,共计335个,其中,二核苷酸重复比例84.18%,三核苷酸重复比例为15.22%,四和六核苷酸重复比例为0.30%。在此基础上,利用软件(serafer 1.3)设计了51对备选SSR引物,以6个滇牡丹不同花色类群DNA为模板对引物进行筛选,其中,10对引物有扩增产物;用这些引物进一步在10个类群50个DNA模板进行多态性测试,结果显示:上述10对SSR引物均有多态性,且同一类群内不同模板DNA间也存在多态性。本研究结果证明:基于牡丹EST信息建立SSR标记是一种有效而可行的方法,有助于滇牡丹遗传多样性分析及基因组学方面的研究。
%K 牡丹
%K 滇牡丹
%K EST
%K SSR
%K 标记
%U http://www.lykxyj.com/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20110206&flag=1