%0 Journal Article
%T 一株肠致病性大肠杆菌的全基因组序列分析
%A 陈重
%A 李多云
%A 程航
%A 邓向斌
%A 邓名贵
%A 潘伟光
%A 杨唯枝
%A 王红燕
%A 姚伟明
%A 余治健
%A 邓启文
%J 中国热带医学
%P 525-528
%D 2015
%X 目的分析并找出肠致病性大肠杆菌Deng（EnteropathogenicEscherichiacoliDeng，EPECDeng）的全基因组序列特点。方法EPECDeng来源于我国婴幼儿腹泻患者的粪便标本，菌株采用诊断血清鉴定血清型，通过自动细菌鉴定仪，使用微量肉汤法进行药敏试验。进一步提取细菌总DNA，构建测序文库，通过Illumina2000仪器测序，然后利用多引物PCR等方法进行补缺口及拼接，最终获得完整的全基因组。采用相关软件获得基因序列，通过对比已知的蛋白数据库进行基因功能注释及生物信息学分析。结果EPECDeng菌株归属O119H6，药敏结果显示该菌株对环丙沙星、左氧氟沙星、氨苄西林及氨苄西林/舒巴坦耐药，对其余的抗菌药物均敏感。EPECDeng基因组包含5233046bp，GC含量50.48%。基因组通过注释后总共有5347个编码蛋白序列，80个tRNA的编码基因，以及22个完整的rRNA基因编码的操纵子。EPEC染色体基因组中含有致病岛，大小约为40Kb左右，与数据库中的一个37Kb的致病岛（AF200363.1）序列极为相似，相似度达到99%。结论完成了肠致病性大肠杆菌基因组精细测序分析，PAI是EPEC致病的关键，为进一步研究菌株的进化关系提供了基因数据。
%K 肠致病性大肠杆菌
%K 高通量测序
%K 全基因组序列
%U http://www.cntropmed.com/CN/abstract/abstract503.shtml