%0 Journal Article
%T 基于SVM方法分析蛋白酶体裂解位点的特异性
%A 刘涛
%A 宋哲
%A 焦春波
%A 刘伟
%A 朱鸣华
%A 王晓钢
%J 化学学报
%P 2341-2347
%D 2008
%X 真核细胞中的泛素-蛋白酶体系统在抗原肽加工呈递途径中发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切位点特异性,采用支持向量机(supportvectormachine,SVM)方法建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型.在相同检验集下,将本模型性能指标与其他预测模型方法比较,结果是本模型性能指标优先,预测准确度为83.1%.由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,反映了蛋白酶体裂解抗原蛋白的相互作用信息,这表明蛋白酶体对抗原蛋白的酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.
%K 支持向量机
%K 蛋白酶体
%K 抗原肽
%U http://sioc-journal.cn/CN/abstract/abstract325402.shtml