%0 Journal Article
%T 基于ISC-SVR方法预测Th细胞表位
%A 于畅宇
%A 刘伟
%A 刘涛
%A 宋哲
%A 朱鸣华
%J 化学学报
%P 670-678
%D 2013
%R 10.6023/A12121059
%X 外源性抗原蛋白被抗原提呈细胞(APC)摄取送入溶酶体中被降解为长度不一的肽段.在HLA-DM分子辅助下,MHCII类分子相关恒定链多肽(classII-associatedinvariantchainpeptide,CLIP)从MHCII类分子的肽结合槽解离,使得外源性抗原降解的肽段进入MHCII类分子空的肽结合槽中,形成稳定的抗原肽-MHCII类分子复合物.之后再被提呈到APC细胞表面供CD4+Th细胞的TCR识别,激活Th细胞分泌细胞因子,促进CTL细胞特异性杀伤靶细胞或辅助B细胞产生抗体.Th细胞的活化对机体的细胞免疫和体液免疫功能都有重要的辅助作用.本工作基于迭代自洽策略与支持向量回归机(ISC-SVR)方法建立了MHCII类分子与外源性抗原肽结合亲合力预测模型,采用13mer扩展核心结合序列可以提高预测模型的性能,分别按照均值法、最大值法、结合法、加权平均值法4种方法计算MHCII类分子与抗原肽的结合亲合力值.对17种MHCII类分子配型进行了回归分析,与其他预测模型相比较,本工作模型都得到了最佳AUC值.最后,以HLADRB1*0101分子为例,分析讨论了MHCII类分子与抗原肽的结合特异性.
%K T细胞
%K 表位
%K 外源性抗原
%K MHC
%K II类分子
%K 支持向量回归机
%U http://sioc-journal.cn/CN/abstract/abstract341907.shtml