%0 Journal Article
%T 南药青天葵转录组SSR位点信息分析
%A 黄琼林
%A 何瑞
%A 詹若挺
%A 陈蔚文
%J 北方园艺
%P 76-79
%D 2015
%R 10.11937/bfyy.201512021
%X 以青天葵全转录组测序获得的142220条unigene为试材，采用MicroSAtellite（MISA）软件分析青天葵简单重复序列（simplesequencerepeat，SSR）的分布频率和重复基元的类型等特征，利用Primer5.0对符合鉴定要求的SSR基元进行引物设计，并通过SSRFinder校验SSR引物，以期为青天葵遗传多样性分析、分子标记辅助育种、遗传图谱绘制等种质资源研究提供参考依据。结果表明在青天葵转录组共检测到分布在5223条unigene上的5684个SSR位点，SSR发生频率为3.67%，分布密度为1/13kb。二核苷酸重复为青天葵SSR主要基元类型，其中AG/CT和AT/AT基序出现频率最高，占SSR总数的52.9%。设计筛选得到2486条SSR引物。青天葵转录组SSR位点出现频率高、类型丰富、多态性潜能较高。
%K 青天葵
%K SSR
%K 位点信息
%K 转录组
%U http://bfyy.haasep.cn/oa/DArticle.aspx?type=view&id=201512021