%0 Journal Article
%T 人Sox10基因启动子区高甲基化的预测和验证
%A 李文英
%A 余鸿
%A 陈兴书
%A 肖岚
%J 第三军医大学学报
%P 2168-2171
%D 2013
%X 目的运用生物信息学方法预测人Sox10基因启动子区甲基化情况并进行实验验证。方法从GenBank获取人Sox10基因序列，利用Methyprimer11.0软件、Lilab、CpGIslandSearcher预测其启动子区CpG岛。进一步运用甲基化特异性PCR（methylationspecificPCR，MSP）和重亚硫酸盐测序(bisulfitesequencingPCR,BSP)方法检测人Sox10基因启动子区CpG岛在多形性胶质母细胞瘤和瘤周组织中的甲基化情况。结果经过生物信息学分析发现,人Sox10基因启动子区存在2个CpG岛,分别为165(1241～1405)bp和105(1478～1582)bp。针对这两个CpG岛设计引物行MSP和BSP实验，研究发现，在人多形性胶质母细胞瘤和瘤周组织中Sox10基因启动子区CpG岛均出现部分甲基化，其中在多形性胶质母细胞瘤中的甲基化率为90.5％，在瘤周组织中的甲基化率为28.5％。结论本研究证实了人Sox10基因启动子区CpG岛在多形性胶质母细胞瘤中出现高甲基化，提示其表达下调可能受甲基化调节。
%K 人Sox基因启动子区甲基化
%K 生物信息学分析
%K MSP
%K BSP
%K 人多形性胶质母细胞瘤
%U http://aammt.tmmu.edu.cn/oa/darticle.aspx?type=view&id=201304048