%0 Journal Article
%T 大豆EST资源的SSR信息分析
%A 陈相艳
%A 李伟
%A 戴海英
%A 张礼凤
%J 大豆科学
%P 394-399
%D 2009
%R 10.11861/j.issn.1000-9841.2009.03.0394
%X 微卫星或简单重复序列（simplesequencerepeats，SSR）存在于表达序列标签（expressedsequencetags，ESTs）中。为了在大豆中开发EST-SSR功能性标记，利用生物信息学对NCBI公共数据库中的394370条大豆ESTs序列进行EST-SSRs特征分析。剔除冗余序列，得到全长为51332.21kb的无冗余EST80735条。在这些序列中搜索出7754个SSR，分布于6674条EST中，出现频率是8.27%。这些EST-SSR的平均长度为15.26bp，平均分布频率是1/6.62kb。在1~6bp的重复基元中，三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高（43.72%），其次是二核苷酸（37.34%）、单核苷酸（15.92%）。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复基元，分别占二、三核苷酸重复的62.83%和25.22%。本研究为开发多态性大豆微卫星标记提供了候选序列。
%K 大豆
%K EST
%K SSR
%K 频率
%K 特性
%U http://ddkx.haasep.cn/oa/DArticle.aspx?type=view&id=200903006