%0 Journal Article
%T 大豆EST序列长度与SSR特性的关系
%A 詹少华
%A 盛新颖
%A 樊洪泓
%A 蔡永萍
%A 林毅
%J 大豆科学
%P 204-209
%D 2009
%R 10.11861/j.issn.1000-9841.2009.02.0204
%X 为了分析大豆EST-SSR的特征和比较其不同长度EST序列中的SSR特性，从NCBI下载了大豆EST序列，应用SSRIT搜索SSR，分析了20183个无冗余的EST序列，发现了1747个EST序列（8.66％）含有SSR，长度超过400bp的EST序列含SSR的比例为10.05％，而长度在400bp以下的EST序列SSR的比例为4.74％。二核苷酸和三核苷酸SSR是大豆EST-SSR的主要类型，分别的60.45％和37.04％，最常见的SSR基元是：AT、AG、AAT、AC、AAG、ACG。在1798个EST-SSR中，51.45％的长度大于12bp，13.35％长度大于20bp。推断NCBI大豆EST数据库中含有123527个SSR，大豆EST-SSR可用于大豆分子标记，具有重要的开发价值，为有针对性设计EST-SSR引物奠定基础。
%K 大豆
%K 表达序列标签
%K EST-SSR
%K 序列长度
%K 重复基元
%U http://ddkx.haasep.cn/oa/DArticle.aspx?type=view&id=200902006