%0 Journal Article
%T 大豆花叶病毒密码子使用及其进化分析
%A 袁瑗
%A 黄赛花
%A 王成坤
%A 智海剑
%J 大豆科学
%P 801-807
%D 2014
%R 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.06.0801
%X 对57个来自不同地区的大豆花叶病毒（SMV)分离物的基因组序列进行密码子使用偏性与进化分析。结果显示，SMV基因组GC含量较低；GC3<50%，说明SMV偏好使用以A/T结尾的密码子；SMV基因组密码子3个位置的GC含量均相互呈极显著相关（P＜0.01)，说明密码子3个位置的碱基组成相关；ENC值为49.42～51.78，密码子偏性存在但并不显著；对应性分析结果表明，第1轴显示67.84%的差异，ENC、GC3、GC12之间的相关性均达极显著水平(P<0.01)，说明密码子的偏性与碱基突变相关；中性绘图及ENC绘图分析均表明密码子使用模式主要受碱基突变影响；密码子使用频率比较结果显示SMV存在19个最优密码子；RSCU的聚类分析证明SMV密码子偏性与病毒地理来源相关。
%K 大豆花叶病毒
%K 密码子偏性
%K 多元分析
%K 进化
%U http://ddkx.haasep.cn/oa/DArticle.aspx?type=view&id=201406002