%0 Journal Article
%T DNA条形码(ITS2)在葫芦科鉴定中应用价值的评估
%A 唐银琳
%A 刘镛
%A 姚辉
%A 陈振东
%A 吴耀生
%A 徐鹏
%A 蒋东
%J 植物科学学报
%P 631-638
%D 2012
%R 10.3724/SP.J.1142.2012.60631
%X ？探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对ITS2序列作为DNA条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物ITS2序列组成的3个资料组,其中Dataset1为实验样本,Dataset2由实验样本及GenBank数据库样本组合,Dataset3为从Dataset2中去除部分序列后所得。通过比较3个资料组的种间、种内的变异、BarcodingGap及鉴定成功率,评估纳入分析的数据选择差异对ITS2鉴定能力的影响。结果显示ITS2序列在3个资料组属水平上的鉴定成功率均达到100%;种水平上,用BLAST1法鉴定成功率分别为100%、67.8%、90.6%,NearestDistance法鉴定成功率分别为100%、52.5%、66.5%。可见纳入分析的数据选择有差异时,会导致鉴定成功率的较大变化。3个资料组中,ITS2分析仅有Dataset2的BarcodingGap不够显著。因此对于DNA条形码分析中的数据纳入标准,值得进一步研究。
%K 葫芦科
%K ITS2
%K 鉴定
%K 应用价值
%K 纳入标准
%U http://www.whzwxyj.cn/CN/abstract/abstract2493.shtml