%0 Journal Article
%T 石斛SSR标记的开发及可转移性分析
%A 邱道寿
%A 郑希龙
%A 蔡时可
%A 郑锦荣
%A 罗焕明
%A 张蕾
%A 邓瑞云
%A 李武
%A 刘晓津
%J 植物科学学报
%P 500-509
%D 2013
%R 10.3724/SP.J.1142.2013.50500
%X ？当前已开发的石斛（Dendrobium）SSR标记仅100余对，难以满足研究的需要。为开发更多石斛分子标记，本研究通过生物信息学方法从公共核酸数据库搜索石斛SSR。结果表明，GenBank收录的3599条石斛DNA序列经拼接获得1343条Uni-DNA序列。经搜索，共检测出283个SSR，分布于205条Uni-DNA序列，平均每2815bp含一个SSR。通过序列比对，剔除86条已开发引物的SSR-DNA序列，从剩余的119条序列设计76对引物，并在石斛属32个种间进行可转移性分析，结果显示47对引物得到有效扩增，种间可转移率为51.1%~95.7%，平均为75.9%。有效扩增引物中有46对在石斛种间具多态性，检测出等位基因数2~8个，平均4.0个。选取10对多态性引物扩增60份铁皮石斛资源，每对引物检测出等位基因数2~5个，平均3.4个。根据SSR扩增带型将60份铁皮石斛资源聚为5大类，同一类型内的表型较类群间接近。对DM121扩增产物测序表明铁皮石斛种内的SSR等位变异由SSR重复次数差异造成，而石斛种间的SSR等位变异还包含SSR位点侧翼序列的插入缺失以及替换。
%K 石斛
%K SSR
%K 开发
%K 可转移性
%K 多态性
%U http://www.whzwxyj.cn/CN/abstract/abstract2560.shtml