%0 Journal Article
%T 籽粒苋丙酮酸磷酸二激酶(PPDK)基因的密码子偏好性
%A 聂江婷
%A 白云凤
%A 贺飞燕
%A 闫建俊
%A 张维锋
%J 植物学报
%P 672-681
%D 2014
%R 10.3724/SP.J.1259.2014.00672
%X ？运用CHIPS、CUSP和CodonW等程序分析了双子叶C4植物籽粒苋(Amaranthushypochondriacus)丙酮酸磷酸二激酶(PPDK)基因的密码子偏好性,并与马铃薯(Solanumtuberosum)和苜蓿(Medicagotruncatula)等双子叶植物及水稻(Oryzasativa)和玉米(Zeamays)等单子叶植物进行了比较,建立了聚类树状图,以期在作物高光效基因工程中为籽粒苋PPDK基因选择合适的受体植物提供依据。研究结果表明,籽粒苋PPDK基因偏好于以A或T结尾的密码子,与其它几种被比较的双子叶作物的PPDK基因密码子偏好性趋势一致,而玉米和水稻等单子叶植物更偏好使用以G或C结尾的密码子。PPDK基因密码子使用偏好性的系统聚类分析表明,籽粒苋与马铃薯和苜蓿等双子叶植物聚为一类,而稗草(Echinochloacrusgalli)、玉米和高粱(Sorghumbicolor)等单子叶植物聚为一类,与系统进化地位一致。但单子叶植物水稻的密码子偏好性与籽粒苋较为接近,与玉米和高粱相差较远。为了选择合适的蛋白质表达系统,比较并分析了籽粒苋PPDK基因的密码子偏好性与大肠杆菌(Escherichiacoli)及酵母菌的异同,发现其与酵母菌的差异小于大肠杆菌,表明选择酵母菌表达系统更为合适。
%K 籽粒苋
%K 密码子偏好性
%K PPDK基因
%U http://www.chinbullbotany.com/CN/abstract/abstract11531.shtml