%0 Journal Article
%T 甘薯与牵牛EST资源的SSR信息分析
%A 兰孟焦
%A 吴问胜
%A 王瑞珍
%A 赵朝森
%A 赵现伟
%J 植物遗传资源学报
%D 2013
%X 为挖掘番薯（Ipomoea）属EST-SSR资源，从NCBI数据库下载23406条甘薯（Ipomoeabatatas(L.)Lam.）EST和62282条牵牛（Ipomoeanil(L.)Roth）EST，利用生物信息学软件预处理、去冗余、拼接处理后得到12812条无冗余的甘薯EST（6.70Mb）和28422条牵牛唯一序列（17.19Mb）。对这些序列进行SSR搜索，在甘薯上获得328个SSR位点，发生频率为2.56%；牵牛上筛选到962个SSR位点，出现频率为3.38%。甘薯和牵牛EST-SSR具有多个共同特征：在SSR位点中，主要是二核苷酸重复类型，其次是三核苷酸重复；在二核苷酸重复中，出现最多的重复基序为AG/CT，其次是AT/AT；在三核苷酸重复中，主要基序是AAG/CCT；SSR位点的长度主要集中在20~22bp。结果表明，这些搜索出的EST-SSR重复基序类型丰富、多态性潜能高，具有较高的开发和利用价值。
%K 番薯属
%K 甘薯
%K EST
%K SSR信息
%U http://www.zwyczy.cn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20130112001&flag=1