%0 Journal Article
%T 辣椒转录组snp挖掘及多态性分析
%A 刘峰
%A 谢玲玲
%A 弭宝彬
%A 欧阳娴
%A 茆振川
%A 邹学校
%A 谢丙炎
%J 园艺学报
%P 343-348
%D 2014
%X 利用snp分析软件从辣椒（capsicumannuuml.）251068条unigenes中筛选出18159个snp，其中有1781个snp位点被匹配在1291个注释基因上，基因功能分类和代谢途径分析表明，其中有853个基因参与初生代谢（28.7%）、细胞代谢（17.3%）、生物合成过程（15.7%），另有125个（9.7%）基因序列参与新陈代谢途径，53条（4.1%）序列参与次生代谢产物合成途径，31条（2.4%）序列参与植物激素合成途径。est-snp序列中4172条（22.9%）满足设计caps引物条件，为了验证est-snp正确性，并选取了15对caps引物对5份辣椒材料进行扩增，结果发现有8对（53.3%）引物表现出多态性。表明筛选出这些est-snp标记可作为辣椒基因分型、图谱构建等的候选分子标记。
%K 辣椒
%K 转录组
%K est-snp
%K caps
%U http://www.ahs.ac.cn/CN/abstract/abstract4342.shtml