%0 Journal Article
%T 许氏平鲉(Sebastes schlegelii)EST-SSR标记开发及通用性检测
%A 薛蕊
%A 马海涛
%A 韩承慧
%A 王斐
%A 孙国华
%A 姜海滨
%J 海洋与湖沼
%D 2015
%R 10.11693/hyhz20141000284
%X 利用已发表的EST序列设计引物并结合PCR筛选的方法,对许氏平鲉多态EST-SSR引物进行了开发。结果表明:(1)许氏平鲉EST-SSR位点发现率为9.14%,核心序列以二碱基重复出现频率最高,占到33.03%,其中以TG/CA基序最为丰富。(2)共设计引物56对, 46对实现有效扩增,其中18对具有多态性。(3)野生群体遗传多样性分析显示,每个位点观测等位基因数(Na)为2-9,平均观测等位基因数为3.89;观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及平均值分别是0.0333-0.8000、0.0333-0.7927和0.3037、0.3757;每个位点的多态信息含量(PIC)在0.0323-0.7522之间,其中高度多态位点5个,中度多态位点5个;经Bonferroni校正后, 3个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡,但两两位点间不存在连锁不平衡现象。(4)许氏平鲉多态EST-SSR引物对朝鲜平鲉、褐菖鲉通用性检测结果表明,引物对二者的通用率和多态率分别为88.89%、100.00%和33.33%、88.89%。研究表明,这些通用引物可用于相关物种的遗传多样性评价、系统进化分析和比较基因组作图等研究。
%K 许氏平鲉
%K 表达序列标签
%K 微卫星标记
%K 通用性
%U http://www.marinejournal.cn/hyyhz/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20150515&flag=1