%0 Journal Article
%T 缢蛏(Sinonovacula constricta)EST-SSR 分布特征及引物开发利用
%A 刘博
%A 邵艳卿
%A 滕爽爽
%A 柴雪良
%A 肖国强
%J 海洋与湖沼
%D 2012
%R 10.11693/hyhz201201022022
%X 采用 CAP3 软件对 NCBI 上的 5296 条缢蛏 ESTs 序列进行了微卫星特征分析。 结果表明, 经拼接、去冗得到非冗余 EST 序列 3453 条, 含 SSR 位点的 EST 序列 267 条, 共 307 个 SSR 位点, 检出率为 8.89%, 平均每 6.83kb 出现 1 个 SSR 位点。设计了 40 对 EST-SSR 引物并进行 PCR 扩增, 29对引物能扩增出理想的 PCR 产物, 其中多态性引物 14 对。利用 14 对多态性引物分析了乐清湾缢蛏遗传多样性, 共检测到等位基因数(Na)61 个, 每个位点的等位基因数为 2—12 个。二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复是最主要的重复类型, 分别占 15.96%、37.13%和 35.50%。乐清湾缢蛏群体观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分别为 0.569、0.490 和 0.449, 表明乐清湾缢蛏遗传多样性较丰富。
%K 缢蛏
%K 表达序列标签(EST)
%K 简单重复序列(SSR)
%U http://www.marinejournal.cn/hyyhz/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=201201022&flag=1