%0 Journal Article
%T AutoSSR：大批量、高效开发和分析SSR基元的软件
%A 王长彪
%A 郭旺珍
%A 张天真
%A 李燕娥
%A 刘惠民
%J 棉花学报
%P 243-247
%D 2009
%R 1002-7807（2009）03-0243-05
%X 为从大量的序列中快速发掘和利用简单序列重复(微卫星，SSRs)，开发了一个软件工具——AutoSSR。该软件能够从一个包括大量FASTA格式的序列文件中发掘SSR，并分析不同SSRs类型的分布状况。与已开发的类似软件相比，该软件可以不受序列数量和不同系统平台的限制，高效、快速完成SSR信息的搜索和分析。利用该软件对GenBank上释放的来源于棉花、苹果和水稻的DNA序列进行了SSR发掘，得到了36000个SSRs。其中，对来源于棉花的SSRs信息，进一步利用Primer3软件开发了位点特异性引物，为棉花基因组分析奠定了基础。
%K 简单序列重复
%K 表达序列标签
%K 发掘
%K 软件
%U http://journal.cricaas.com.cn:8083/Jweb_mhxb/CN/Y2009/V21/I3/243