%0 Journal Article
%T 黑白轮枝菌基因组中微卫星的频率和分布
%A 李志芳
%A 冯自力
%A 赵丽红
%A 师勇强
%A 李彩红
%A 王玲飞
%A 刘义杰
%A 朱荷琴
%J 棉花学报
%P 135-141
%D 2013
%R 1002-7807（2013）02-0135-07
%X 为了明确重要植物病原真菌黑白轮枝菌基因组中的微卫星（SSR）分布情况，利用软件SciRoKo从已测序的VaMs102菌株基因组（32.8Mb）中，成功搜索得到4224个SSR。结果显示，三碱基重复微卫星的数量最多，为1481个，占SSR总数的35.1%；其次是二碱基、六碱基、四碱基和五碱基；单碱基重复的微卫星数量最少，为308个，仅占总数的7.3%。不同重复单元的微卫星在黑白轮枝菌基因组中的分布是非随机的，具有明显的偏好性。单碱基、二碱基、四碱基和五碱基偏爱出现于非编码区，尤其是基因间区。三碱基和六碱基重复微卫星较为集中分布在外显子区，并且重复次数变化丰富，推断黑白轮枝菌编码区的SSR可能会通过调节自身的重复次数来适应新环境。
%K 黑白轮枝菌
%K 基因组
%K 简单重复序列
%K 非随机分布
%U http://journal.cricaas.com.cn:8083/Jweb_mhxb/CN/Y2013/V25/I2/135