%0 Journal Article
%T 利用高通量测序技术鉴定棉纤维发育相关miRNAs及其靶基因
%A 南文智
%A 吴嫚
%A 于霁雯
%A 范术丽
%A 黄双领
%A 李兴丽
%A 张红卫
%A 张金发
%A 喻树迅
%J 棉花学报
%P 300-308
%D 2013
%R 1002-7807(2013)04-0300-09
%X miRNA（microRNA）是一类21～24个核酸长度的非编码小分子RNA（sRNA），它主要通过抑制或降解靶基因来调控植物生长发育等过程。试验利用在纤维长度上有显著差异的2个回交自交系BILs（Backcrossinbredlines）的0DPA（Dayspostanthesis）、3DPA的胚珠和10DPA的纤维构建6个sRNA文库并进行Solexa测序。以已公布的棉花D5基因组序列和棉属其他序列为参考，经分析共发现561个miRNAs，其中包括254个已知的miRNAs（属于40个miRNA家族），75个候选的miRNAs和232个新的miRNAs，研究结果极大地丰富了棉属miRNAs。通过miRNA靶基因预测分析发现多数miRNAs负调控其对应的靶基因，少数正调控。KEGG（Kyotoencyclopediaofgenesandgenomes）注释结果表明miRNA的靶基因在植物激素代谢途径中显著富集。
%K 棉花miRNA
%K 高通量测序
%K 棉花D5基因组
%K 靶基因预测
%U http://journal.cricaas.com.cn:8083/Jweb_mhxb/CN/Y2013/V25/I4/300