%0 Journal Article
%T ER+和ER-乳腺肿瘤细胞中mRNA和非编码RNA的表达模式
%A 蔡晶晶
%A 杨晟
%A 张慧
%A 郭丽
%A 陈峰
%A 吴倩
%J 科学通报
%P 1861-1873
%D 2014
%R 10.1360/972013-986
%X 利用microarray分别获得MCF-7（雌激素受体阳性，ER+）和MDA-MB-231（雌激素受体阴性，ER-）两种乳腺肿瘤细胞的miRNA，lncRNA和mRNA表达谱.筛选差异表达的miRNA，预测其靶基因;对lncRNA和mRNA芯片数据进行生物信息学分析，对差异基因进行geneontology（GO）和pathway（信号通路）分析.对差异表达的mRNA和miRNA的靶基因作交集，再与差异表达的lncRNA建立共表达关系，在mRNA-lncRNA共表达网络中导入miRNA-mRNA相互作用，借此获得关键miRNA-mRNA-lncRNA相互作用.结果发现雌激素受体表型不同的乳腺肿瘤细胞中mRNA和非编码RNA的表达有显著性差异.在差异表达的miRNA中，miR-19a-3p，miR-19b-3p等在MCF-7细胞中表达明显下调，miR-148b-3p等在MCF-7细胞中表达显著上调.差异表达miRNA的靶基因分析结果显示，miR-19a-3p和miR-19b-3p的靶基因为ESR1;在差异表达的lncRNA中，uc001vet.1（DLEU1，Fc=15.44），uc001ver.2（DLEU1，Fc=4.13）在MCF-7细胞中的表达明显增高.共表达分析表明，ESR1与uc001vet.1和uc001ver.2具有较高的共表达系数，而且miR-19a和miR-19b与DLEU1均在13号染色体上.推断miR-19a和miR-19b可能与DLEU1共同作用影响ESR1的表达.由此推断miRNA-mRNA-lncRNA相互作用影响不同雌激素表型乳腺癌肿瘤细胞的发生发展，雌激素受体可能受miRNA和lncRNA的共同调控作用.
%K miRNA
%K 长链非编码RNA
%K mRNA
%K 雌激素受体
%K 乳腺癌
%U http://csb.scichina.com:8080/CN/abstract/abstract514561.shtml