%0 Journal Article
%T 基于质谱和生物信息学分析的小菜蛾蛋白质鉴定
%A 谢苗
%A 成娟
%A 尤民生
%A 杨广
%A 蔡敬轩
%J 昆虫学报
%P 1206-1212
%D 2009
%X 本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutellaxylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析.采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析,获得该点的肽质量指纹图谱（PMF）及串联质谱（MS/MS）图谱。将获得的PMF分别用MASCOT和ProFound等常用软件在NCBInr的Metazoa蛋白质数据库进行搜索,匹配结果不理想.进一步用PMF+MS/MS谱图搜索NCBInr的Metazoa蛋白质数据库,以及小菜蛾EST数据库。在NCBInr库中匹配结果为拟暗果蝇Drosophilapseudoobscura中的一种假定蛋白GA18218-PA,而用EST库搜索的结果为家蚕Bombyxmori的ATP合酶的亚基。为验证搜索结果,将该蛋白质点进行磺基异硫氰酸苯酯（SPITC）化学衍生后denovo测序,最后确认该点可能为ATP合酶的一个亚基。最后着重讨论了蛋白质的质谱鉴定与生物信息学分析的联合使用,希望据此选择出最适合于非模式昆虫蛋白质组学鉴定的方法。
%K 小菜蛾
%K 蛋白质
%K 肽质量指纹图谱
%K 串联质谱
%K de
%K novo测序
%K 生物信息学
%U http://www.insect.org.cn/CN/abstract/abstract9289.shtml