%0 Journal Article
%T 家蚕第12连锁群EST-SSR标记的筛选和分析
%A ？米智
%A 李傲祥
%A 阮成龙
%A 李冠楠
%A 杜文华
%A 隆耀航
%A 朱勇
%J 昆虫学报
%P 1223-1230
%D 2011
%X 为了探究家蚕BombyxmoriEST-SSR标记的多态性，对检索获得的家蚕第12连锁群的4465条EST序列进行了分析，整理和拼接后得到581条非冗余EST序列，总长度约为480kb。其中，有122条序列中共检测到154个EST-SSR，占所研究的EST序列的2.73%，平均每3.12kb含有一个EST-SSR。在所检测的EST-SSR中，三核苷酸和四核苷酸重复是主导类型，分别占总数的36.36%和28.57%,大部分表现为Perfect形式；核苷酸重复平均长度约为16.2bp，最长为30bp。进一步进行同源性分析，发现有26条序列可以在NCBI中检索到同源序列，在这些序列中一共含有40个SSR,其中14个(35.0%)位于5′-UTR,11个(27.5%)位于3′-UTR,15个(37.5%)位于CDS区。根据筛选到的微卫星序列设计11对引物，其中8对引物有扩增产物，且条带清晰；应用引物ES1204对8个家蚕品种进行PCR扩增都呈现多态性。结果说明通过家蚕EST数据库发掘SSR标记是一条可行的途径。
%K 家蚕
%K 连锁群
%K 表达序列标签
%K EST-SSR标记
%K 多态性
%U http://www.insect.org.cn/CN/abstract/abstract13394.shtml