%0 Journal Article
%T 盘基网柄菌肌动蛋白的生物信息学分析
%A 李广
%A 刘淑艳
%A 李玉
%A 陈艳秋
%J 菌物学报
%P 443-455
%D 2015
%R DOI:10.13346/j.mycosystema.140025
%X 盘基网柄菌Dictyosteliumdiscoideum是目前黏菌中研究最清楚的模式生物，其捕食过程与肌动蛋白的多聚化密切相关。为探讨盘基网柄菌肌动蛋白的序列特征，本研究利用生物信息学方法分析了盘基网柄菌32条肌动蛋白的蛋白-蛋白相互作用（protein-proteininteraction）和可能含有的保守基序。结果表明：盘基网柄菌32条肌动蛋白与其他蛋白存在一组复杂相互作用关系和5组比较简单的相互作用关系；利用MEMESUITE分别分析盘基网柄菌32条肌动蛋白序列的保守基序和与actin17呈最佳匹配的21种生物肌动蛋白的保守基序，结果共获得6个保守基序，即motif1，motif2，motif3，Motif1，Motif2，Motif3。其中motif1，Motif1，Motif3为本研究新发现的保守基序，这3个保守基序可定位于Profilin-actin-VASP202–244(PDBID:3CHW)三维结构的重要位置。以上结果表明actin3，actin10，actin14，actin15，actin17，actin31可能为盘基网柄菌比较重要的肌动蛋白；motif1，Motif1，Motif3可能是盘基网柄菌肌动蛋白在进化中重要的保守基序。
%K 黏菌
%K 蛋白相互作用
%K 基序分析
%U http://manu40.magtech.com.cn/Jwxb/CN/abstract/abstract3137.shtml