%0 Journal Article %T 耐辐射奇球菌Deinococcusradiodurans中非编码RNA %A 陈仲中 %A 王梁燕 %A 林军 %A 田兵 %A 华跃进 %J 核农学报 %P 383-387 %D 2006 %X 耐辐射奇球菌(DeinococcusRadiodurans)对电离辐射、紫外线以及强氧化剂等方面具有惊人的抗性。非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA)在参与转录调控、RNA的加工与修饰、mRNA的转录、蛋白质的运输与稳定性调节等方面具有非常明显的作用。本文通过概率上下文无关算法(StochasticContextFreeGrammar,SCFG),对耐辐射奇球菌R1菌株的基因间序列进行相似二级结构预测,结果发现,在耐辐射奇球菌R1基因组的非编码区存在28个非编码RNA家族。其中IRE家族成员最多,其次是Histone3、tRNA和SECIS家族。所发现的DicF与ctRNA_pGA1t、mRNA等家族成员为细菌所特有。与其他生物比较分析结果显示,可以用这些非编码RNA来研究耐辐射奇球菌的生物学功能,并为进一步研究其DNA损伤与修复分子机制提供依据。 %K 耐辐射奇球菌 %K 非编码RNA %K RNA %K 二级结构 %U http://www.hnxb.org/CN/abstract/abstract8896.shtml