%0 Journal Article
%T 盐藻CDPK基因的克隆与生物信息学分析
%A 张晓琳
%A 柴晓杰
%A 张婷
%A 余祝君
%A 薛飞
%J 核农学报
%P 418-424
%D 2013
%X 为了研究CDPK基因的结构和功能,应用RT-PCR和RACE方法从盐藻Dunaliellasalina中克隆得到CDPK基因(GenBank登录号为JQ964113),并对其进行生物信息学分析。结果表明盐藻CDPK基因的cDNA全长3052bp。5'-UTR长70bp;开放阅读框长1650bp,编码549个氨基酸;3'-UTR长1332bp。蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水,二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。亚细胞定位于叶绿体和细胞核中,无跨膜结构域,无信号肽。蛋白序列中存在4个丝氨酸磷酸化位点、4个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白激酶结构域在53~331位氨基酸处,蛋白激酶ATP结合域在59~82位氨基酸处,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性域在173~185位氨基酸处,4个EF-hand钙结合域分别在357~385、393~421、429~457、465~493位氨基酸处。进化分析结果表明,克隆的CDPK基因与团藻、衣藻、盐藻Dunaliellatertiolecta的CDPK亲缘关系最近。为进一步研究CDPK基因的功能及探究盐藻耐盐机制的信号转导途径奠定了分子基础。
%K 盐藻
%K 钙依赖蛋白激酶(CDPKs)
%K cDNA全长
%K 生物信息学分析
%U http://www.hnxb.org/CN/abstract/abstract11055.shtml