%0 Journal Article
%T 毛竹IDD基因家族的生物信息学分析
%A 关鹰
%A 许在恩
%A 郭小勤
%J 核农学报
%P 998-1005
%D 2014
%R 10.11869/j.issn.100-8551.2014.06.0998
%X IDD基因家族编码一种混合型的转录因子，本文通过本地Blast从毛竹（Phyllostachysheterocycla）基因组数据库获取到了9个IDD家族基因，并命名为PhID1和PhIDD1-8，其氨基酸序列均具IDD-domain结构特征，一个假定的核定位信号、2个C2H2和2个C2HC。氨基酸理化性质分析发现，PhIDD蛋白均为亲水性蛋白，含量较多是丙氨酸（Ala）、丝氨酸（Ser）和甘氨酸（Gly），全序列等电点分布在8.8~9.7之间，仅PhIDD2蛋白的等电点为5.6。除PhIDD2外，IDD-domain的等电点与全序列等电点基本一致。PhIDD蛋白二级结构含量分析发现无规则卷曲和α-螺旋含量最多，β-转角和延伸链分布在整个蛋白中。蛋白磷酸化位点预测结果显示磷酸化位点数量在20~29个不等。三维结构分析显示，PhIDD1在63-175氨基酸处，会形成α-螺旋，β-折叠及无规则卷曲及明显的锌原子结合位点。
%K 毛竹
%K IDD基因家族
%K 转录因子
%K 生物信息学
%U http://www.hnxb.org/CN/abstract/abstract11416.shtml