%0 Journal Article
%T 从真菌全基因组中筛选丛赤壳科的DNA条形码
%A 曾昭清
%A 赵鹏
%A 罗晶
%A 庄文颖
%A 余知和
%J 中国科学 生命科学
%P 55-63
%D 2012
%X 将粗糙脉孢菌(Neurosporacrassa)的注释基因分别与30种丝状子囊菌基因组比较,根据E值大小预测同源序列,从中选择Hsp90,AAC,CDC48和EF3作为候选基因,以丛赤壳科(Nectriaceae)13个属34个概念清晰的种为材料,对215个序列片段采用不同方法进行分析,筛选适合于该科的DNA条形码.将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标.结果表明,Hsp90和AAC基因虽然具有较高的PCR扩增与测序成功率,但种内、种间距离频率分布存在重叠,可能导致部分种的鉴定错误;CDC48基因可以恰当地区分种内与种间差异,但扩增与测序成功率相对较低;EF3基因不存在种内、种间遗传距离重叠,序列容易获得,适合作为该科真菌的DNA条形码.
%K E值
%K 同源基因序列
%K PCR扩增与测序成功率
%K 序列分析
%U http://life.scichina.com:8082/sciC/CN/abstract/abstract506345.shtml