%0 Journal Article
%T 基于转录组测序在人类全基因组内鉴定与癌症相关的polyadenylation和non-polyadenylationRNA
%A 赵国光
%A 焦飞
%A 廖奇
%A 罗海涛
%A 李慧
%A 孙亮
%A 卜德超
%A 余鲲涛
%A 赵屹
%A 陈润生
%J 中国科学 生命科学
%P 376-386
%D 2013
%X 真核生物的mRNA包括2种形式的转录本,根据它们3'端是否存在poly(A)尾巴,可以分为带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)+mRNA)和不带poly(A)的mRNA(简写成poly(A)-mRNA).Poly(A)+mRNA的主要功能是促进蛋白质的编码,但是对poly(A)-mRNA的功能却知之甚少.而已有的研究表明,poly(A)-mRNA和双态(bimorphic)的mRNA(即包含poly(A)+mRNA又包含poly(A)-mRNA)也是基因转录的一个重要部分.本研究通过建立一个综合性的数据分析流程,首先从不同细胞系中鉴定出这些不同形式的mRNA,然后比较这些poly(A)+及poly(A)-mRNA在正常细胞系和对应的癌症细胞系中的表达差异,从而确定这些RNA转录物的潜在功能.通过生物信息学的分析表明,在正常和肿瘤细胞系中确实存在差异表达的poly(A)+和poly(A)-mRNA.对差异表达的基因进行功能富集,结果表明,这2类mRNA都富集了包括细胞周期、细胞凋亡及细胞死亡相关的功能,而这些功能已经被证明和癌症的发生和发展是密不可分的.此外,还有一类差异表达的poly(A)-mRNA富集了和翻译及翻译延长相关的功能.因此,本研究表明,poly(A)-mRNA也可能在癌症的发生和发展中发挥着重要的作用.
%K 多聚腺苷酸化
%K 非多聚腺苷酸化
%K 功能注释
%K 高通量测序
%K 癌症生物信息学
%U http://life.scichina.com:8082/sciC/CN/abstract/abstract511009.shtml