%0 Journal Article
%T Dise o de un sistema de PCR para la detecci車n del virus del papiloma humano mediante el uso de oligonucle車tidos degenerados de la regi車n E6
%A Danmarys Hern芍ndez
%A Jhon Cruz
%A Militza Quintero Vega
%A Marco Bastidas
%J Revista de Obstetricia y Ginecolog赤a de Venezuela
%D 2012
%I Sociedad de Obstetricia y Ginecolog赤a de Venezuela
%X Objetivo: Dise ar y estandarizar un sistema de PCR para detectar un amplio espectro de tipos de VPH en una sola reacci車n utilizando como blanco la regi車n E6 del genoma viral. M谷todos: Utilizando secuencias del gen E6 de distintos tipos de VPH del NCBI y las herramientas inform芍ticas Mult Alin versi車n 5.4.1. y Oligo Analyzer 1.1.2 se dise aron oligonucle車tidos degenerados que permit赤an la amplificaci車n de un fragmento de aproximadamente 214 pb. Las muestras seleccionadas incluyen: 25 muestras de ADN, cada una positiva para un solo tipo de VPH tipificados por el sistema PCR-RFLP MY11/MY09 del gen L1. Resultados: Se obtuvieron amplificados de aproximadamente 214 pb de 25 tipos distintos de VPH, se detectaron amplificados de E6 en muestras negativas para el sistema MY09/MY11. Conclusiones: Se pudo determinar que el dise o de los oligonucle車tidos degenerados fue altamente eficiente para la amplificaci車n de por lo menos 25 tipos distintos de VPH lo que facilitar赤a la detecci車n en muestras cl赤nicas. Objective: Design and standardize a PCR system to detect a broad spectrum of HPV types in a single reaction using target the E6 region of the viral genome. Methods: Using E6 gene sequences of different HPV types and NCBI tools Mult Alin Oligo Analyzer version 1.1.2 5.4.1. Degenerate oligonucleotides were designed that allowed amplification of a fragment of approximately 214 bp. Selected samples include: 25 DNA samples, each positive for a single HPV type typified by PCR-RFLP system MY11/MY09 L1 gene. Results: We obtained approximately 214 bp amplified from 25 different HPV types were detected in samples amplified from E6 negative MY09/MY11 system. Conclusions: It was determined that the design of degenerate oligonucleotides was highly efficient for amplification of at least 25 different HPV types which would facilitate detection in clinical samples.
%K VPH
%K Gen E6
%K PCR
%K MY09/MY11
%K HPV
%K E6 gene
%K PCR
%K MY09/MY11
%U http://wwww.scielo.org.ve/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0048-77322012000400005